Uus tehisintellekti tööriist scGPT suudab tuvastada rakutüüpe, ennustada häirivate geenide mõju ja täpselt määrata, millised geenid omavahel suhtlevad.
Teadlased uurivad haiguste põhjuste teadasaamiseks sageli terveid rakupolulatsioone. Näiteks kasutavad teadlased RNA hulgijärjestamist, et avastada ravitavate vähiga seotud valgu sihtmärke ja potentsiaalseid verepõhiseid biomarkereid Alzheimeri tõve varajaseks diagnoosimiseks.
Viimasel ajal on teadlased pöördunud üherakulise RNA sekveneerimise (scRNA-seq) poole, mis annab ülevaate sellest, kuidas geeniekspressioon üksikute rakkude vahel varieerub. Tavaliselt analüüsivad teadlased scRNA-seq andmeid, kasutades selleks tehisintellekti mootoreid.
Toronto ülikooli teadlased on loonud uue tehisintellekti mudeli, mida nimetatakse üherakuliseks generatiivseks eeltreenitud transformaatoriks või scGPT-ks, mida saab peenhäälestada, et viia läbi erinevaid ülesandeid kasutades scRNA-seq andmeid. Need ülesanded hõlmavad konkreetsete geenidega manipuleerimise mõju ennustamist ja erinevate andmepartiide ühendamist, et paljastada muidu tuvastamatud rakutüübid.
scGPT´i saab muuta erinevateks versioonideks, mis täidavad mitmesuguseid ülesandeid. Näiteks üha populaarsemaks muutuv tehisintellekti mootor ChatGPT töötab samamoodi. Kui vestlusbot genereerib lause järgmised sõnad, siis scGPT ennustab geenide ekspressioonitasemeid rakus.
Allikas: The Scientist
Click here to add your own text
